每一轮的亲和选择包括原始的或富集的gⅥ—cDNA文库中噬菌粒颗粒的获取和纯化以及它们自身的淘选过程。介绍两种不同的方法来抽提特异的噬菌体。
1噬菌体文库的获取和纯化
在每轮淘选循环中的起始部分,(富集的)Topl0F,
细胞经辅助噬菌体被双重感染以便产生和纯化gⅥ—cDNAt噬菌粒颗粒,从而进行下一轮的淘选。在淘选过程中,如果没有特异的缓冲液且噬菌体对诱饵的亲和力较高(如
免疫亲和筛选),此时经双重感染获得的噬菌体颗粒并不一定要纯化。
2生物素化的诱饵的制备
用不同的配体标准化淘选的一个方法是用普通的标记物(如生物素)来标记诱饵,或使用链霉亲和素包被的酶联免疫吸附实验(ELISA)的平板孔或小珠来淘选。两个有效的(氨基反应的)生物素化试剂是二硫化N—羟基丁二酰亚胺生物素酯(biotin disulfide N—hydrox—ysuccinimideester)和生物素化氨基己酸—N—羟基丁二酰亚胺(biotinamidocaproate N—hydroxysuccinimide)(Sigma)。与后者试剂相比,前者在生物素和诱饵之间有一个可切断的二硫键,它是在生物淘选过程中特异抽提(用50mmol/L二硫苏糖醇)噬菌体的试剂,整个生物素的水平可用HABA方法来评估。
3用生物素化的诱饵的淘选过程
在用生物素化的诱饵来亲和纯化gⅥ—cDNA噬菌体颗粒的标准过程中,用链霉亲和素包被的磁珠预处理噬菌粒文库,以便首先除去与链霉素非特异结合的噬菌体颗粒。在第三轮淘选后,个别克隆可用ELISA来分析或进行额外的淘选过程。然而,必须注意到成功的展示要求pⅥ融合蛋白定位在外周胞质上,正确地折叠并组合成完整的噬菌体颗粒。这样的话,如果表达pⅥ融合蛋白的结合者干扰了选择过程,那么将会稀释“非干扰”结合者的浓度。
4免疫亲和淘选过程
用抗血清来分离gⅥ—cDNA噬菌体颗粒,而且所需要的抗血清是微量的(微升数量的)。