新技术突破单分子测序限制--宝叶

一个概念上不同的方法就是纳米孔测序，这种方法是让单链DNA通过某种膜上的小孔，利用孔中变化的电流来读取碱基序列信息。近期在基因组生物与技术大会（Genome Biology and Technology meeting）上，来自Oxford Nanopore的技术总监Clive Brown报道了他们完成的两个病毒基因组序列，这些序列具有单复合碱基读长（single multikilobase reads）的特点。生物通 www.ebiotrade.com
然而尽管如此，纳米孔测序技术仍然未得到证明，除非这些结果能够发表，未来会告诉我们这一技术能走多远。

那么zui终限制磁测序技术发展的可能又有哪些呢？生物通 www.ebiotrade.com
同时进行监测的磁珠数目决定了密度可能与目前扩增的测序仪相同（比如HiSeq 2000每平方毫米约75万次），这受限于磁珠的大小，连接DNA模板的长度，以及光学分辨率限制。
成像速度受限于磁珠的机械运动，而这又由拉动力决定。有可能速度能达到每秒至少十微米（等同于游动细菌的速度），也就是说一秒钟能完成十个开闭循环。而实际上发夹结构熔合和退火动力学并不大可能受到限制，因此成像速度也许可以比每秒一张图像更快。这似乎能满足目前商业化“新一代”测序仪的要求，大大延长读长。但是纳米孔测序一旦成功，将难以匹敌——因为这种技术读长能达到100kb，比目前的仪器通量更大。生物通 www.ebiotrade.com
然而即使这项成果提出了令人信服的证据，但这离实际操作，*测序方法还远。相反这一技术更多的也许是提出了许多可能性，比如定位将有助于提升单核苷酸差异检测。这也开启了合成测序的可能性。
另外一方面，这种技术也有可能利用快速操控磁场，进行实时监控测序。这些前景都很诱人，因为它不需要重复循环的试剂，从而简化了仪器设计。